近年来，抗生素的普遍使用使越来越多的细菌产生了耐药性，尤其值得注意的是，这种危害性随着抗生素在畜牧养殖中的大量使用而变得更加突出。国家细菌耐药性监测中心副主任马越研究员在第10届全军检验医学学术会议上说，目前滥用抗生素的现象远比人们想象的要严重，全球每年消耗的抗生素总量中90%被用在食用动物身上，且其中90%都只是为了提高饲料转化率而作为饲料添加剂来使用。这些做法导致动物中大量耐药菌株的出现，使得原有的抗生素失去作用，原来已经控制住的动物细菌病时有大面积暴发，给畜牧业造成较大的危害。更为严重的是，人如果经常食用含有抗生素的动物产品也可能产生耐药性，一旦发生细菌感染，即使从来没有使用过抗生素药物的人，同样可能面临抗生素治疗束手无策的局面。
在畜禽养殖过程中使用抗生素虽然能够带来短期的经济利益，可是利益背后所隐藏的健康危机，如果不从源头上加强管理，必将给整个畜牧产业，乃至人类的生命安全造成威胁。因此如何采取具体措施，合理使用抗生素，抑制抗生素在养殖业中的滥用，是维护畜牧业健康可持续发展的必由之路，是畜牧管理部门应该关注的焦点之一。
晓之以理使之不想用。加大对滥用抗生素危害性的宣传力度，提高大众对抗生素的辩证认识。识其利更要知其害，要使养殖者认识到畜禽的健康并不是靠抗生素的维持，而是靠严格的管理手段、科学的饲养技术和清洁的养殖环境来实现的。同时畜牧主管部门要加强对养殖户和基层畜牧兽医工作人员合理使用抗生素技术的培训，推广规范处方用药制度，鼓励养殖场户按照《中国兽药典》的配套书《兽药使用指导手册》的规定科学合理用药。
驱之以利使之不愿用。通过开发出更多绿色、安全的动物饲料添加剂替代抗生素来确保养殖者的利益；同时政府相关职能部门应该完善市场监督体系，加强对动物产品的监管和标识，抗生素残留畜产品和无残留产品在价格上体现出差别，通过价格杠杆引导养殖户主动控制抗生素的使用。
规之以法使之不敢用。加强对在畜牧生产中抗生素使用情况的监管，将动物使用抗生素纳入政府医药监控体系，完善药品物流系统管理。可根据当前我国实际情况，由国家相关职能部门建立起统一管理动物饲养、运输、屠宰加工、市场营销、进出口以及疾病扑灭和环保条件的执法管理办法，健全食品生产到餐桌的全程安全监控体系，对动物产品实行市场准入制和产地追溯制，使畜牧产品的生产有法监督，对敢于乱用、滥用抗生素的养殖者能够依法严肃查处，维护好畜牧安全生产的大环境。